为自己植入了亚当的胚胎之后，碇源堂发现自己被这胚胎所同化了，他蜕变成了另外一种强大的生命体，拥有了可以击败使徒的力量。
唯一的缺陷是，他需要大量的能源来维持自己的生命。
不过，这并不是负担，作为NERV总部的司令，动用一些能源不算什么。
而在天空上，在近地轨道上，袁大古立在一颗人造卫星上，这颗环绕着地球轨道进行高速飞行的卫星，此时刚好来到了第三新东京市的上空：“十分钟的时间已过……我将驾驶三号机出击！”
然后，他一跃而下，向着第三新东京市俯冲而去，而在他的身后，一个巨大的集装箱跟着俯冲而下，宛若一枚巨大的炮弹砸向了地球，外部安装的喷射端口不断地喷射出高热火焰，校准着路线。
人造卫星开始变形，露出了一个炮口，一道明亮的光束直射地面，瞄准的位置刚好是预警当中要求撤离的范围，几乎是一瞬间，明亮的光束链接着天空与大地，庞大的热量在与空气的接触中释放，就连云层都被轰散了，气温飙升不知几许。
这还是逸散的一点能量，真正受到打击的目标，一瞬间便被击穿。
巨大的坑洞出现在了第三新东京市的地表，居高临下地望去，可以看到地下都市的痕迹，还有那金字塔形状的总部基地。
地下基地内，警报声接连响起：“检测到高能反应……位置是，太空！”
“一颗卫星对我们发动了攻击！”
“总部基地上方的二十四层特殊装甲被击穿！”
“检测到物体正在快速地靠近，根据轨道计算，将会通过光束打击产生的空洞进入地下都市。”
“预计时间，十五分钟！”
十五分钟，这是自由落体所需要的时间，也是留给他们最后的准备时间了。
绫波丽坐上了初号机，被发射到了地下都市当中，初号机的身后拖着长长的脐带线缆，脚边摆放着一个又一个的箱体，里面是为EVA打造的巨型战斗兵器，原本属于三台不同的机体，此时只有初号机出击，全部给它用了。
在精神与初号机产生链接之后，绫波丽察觉到了一个意识在与她交流，在说些什么。
但是那个声音太模糊了，她听不太清。
“五，四，三，二，一。”
非常精准的，丝毫不带减速的，巨大的集装箱通过了空洞，从地表直入了这地下都市当中，巨大的冲击诱发了一场微型地震，让基地内的人东倒西歪的。
而初号机抓住了这个时机，双持自动步枪，瞄准那巨大的集装箱扣动了扳机，汹涌的子弹向着集装箱的位置扫去，一把枪械的弹药打空后直接被丢到一边，自然有别的枪械进行补充。
在那子弹的打击下，因为穿越大气层而焦黑的集装箱散落，露出其中装着的货物。
一台六十米高的机器人出现在那里，机器人具备着流畅的身形，身上是银、紫、红的三色配色，胸口有着黄金黎明的标志——正是机械奥特曼。
那些子弹击打在它的身上，根本不起作用。
“目标体内产生了高能反应！”NERV的工作人员喊到：“能量正在向着目标的腕部汇聚，能量属性相反！”