旧型方舟反应炉的改造升级，其实一开始只朝着两方面下手，一是建造反应炉的材料与设计，一是控制系统。并没有直奔理论，动反应炉的核心部分。
相较于完成在上个世纪67年的方舟反应炉，当时最先进的配套科技，如今已经是落后三十六年的老东西。说淘汰倒不至于，但有不少东西都已经有更好的选择了。
譬如控制系统的升级。经历先期规划，然后新旧双系统并行，离峰时段移转控制权，并进行压力测试。
等到完全没问题之后，才将控制权限完全转移到更便捷，以及安全性更高的新系统上。
建造材料的汰换升级，也是视不同部位、不同重要性来进行的。譬如有复数管道的，就利用离峰时段，压力较小的时间，逐一更换升级。
无法在热运转状态下做更换的，则制定计划。预备放在圣诞节─新年假期，停机岁修的时候一并完成。
这也是为什么从一开始的时候，参与方舟反应炉升级计划的一般研究人员有办法协助的理由。因为托尼·史塔克等人做好规划，就由底下的人执行。
托尼·史塔克、奥托·奥克塔维斯和亨利等三人，也不全在做这些无关紧要的小事。他们将跟方舟反应炉有关的所有学术论文从头开始梳理，完善缺失的理论。
希望在没有关键参照物——即宇宙魔方。不过此时除亨利外，没有人知道这点，——可以参考的情况下，让方舟反应炉的冷核聚变理论可以逻辑自洽。
一般来说，一套理论要是缺了核心的部分，只有开头跟结尾，这套理论直接扔进废纸篓也不为过。
偏偏方舟反应炉有一个已经在实际运转的实体存在，证明这套理论的开头与结尾是正确的。那么如何补全这个缺失的核心，就成为一道难题。
没有可参照物，就算亨利有超级大脑，他也无法凭空想象出答案来。所以他就陪着另外两人慢慢推导，一齐将方舟反应炉的所有方程式一一补全。
作为冷核聚变的标志性反应炉，是利用‘钯’元素为电极，在常温、常压的重水中进行电解。除了产生氢，还可以释出渺(μ)子。
渺子是一种不稳定的亚原子粒子，类似电子，但质量是电子的207倍以上。
只要让渺子在氢分子中取代一个电子，就会因为质量变大，让氢分子中的氢原子核互相吸引，比一般状态下更为靠近，从而诱发核聚变反应。
这套方法，在亨利穿越前的世界同样存在。然而渺子催化融合早在1950年代，就已经被证实不具有实用价值。
因为渺子寿命太短暂，可用于触发核聚变的时间窗口极短。又很难控制，难以使其进入原子核周围轨道，取代电子。无法取代质量小的电子，就不会有后续的反应。
但是在漫威宇宙，这个方法被实现了！
要点就在于让整套流程跑起来，并利用磁约束技术，将其限制在极小范围内，增加渺子进入原子核周围的机率。而不是在静态状况下，被动等待渺子偶然间取代电子。
而被取代的电子则会被释放出来，成为自由电子。当多个自由电子共同移动，所产生的净流动现象就称为电流，这便是可输出的能量了。
整个过程，虽然也会有放热现象，但基本上都还是维持在常温、常压状态。没有出现离子流等级的超高温，也不需要利用这些的热量去转换成电力。
但是这套以冷核聚变为基础的方舟反应炉，也不是毫无缺点。纵使在亨利等人的计算中，有办法提高效费比，使其具备商转价值，但是核废料的污染，又成为另一道难题。
核聚变发电的一大卖点，就是干净无污染。聚变反应后的物质，是不具有辐射线，更不是半衰期长达几万年的核废料。